Pepsin je trávicí enzym, který se vytváří v žaludku, v buňkách žaludeční sliznice jako proenzym a v žaludku je aktivován. Pomáhá rozkládat bílkoviny. Nejvíce je aktivní v silně kyselém prostředí, které zajišťuje kyselina chlorovodíková, též přítomná v žaludku.